Vale, con CPU pequeña entiendo que te refieres a la torre. Mi torre no es grande, de hecho la prefiero relativamente pequeña para que sea manejable, ya que me la llevo a cientos de kilómetros a menudo.
Mi caja es una medion como la de la foto:
Y ahí dice "Dimensiones 410x365x180 mm."
Si la tuya es parecida entra sin ningún problema. Tendrías que tener un buen barullo montado en ella para que algo se interpusiera por encima de la placa base y no cogiera.
De hecho esta gráfica mide 18 cm de largo y unos 4 de grosor. (El ancho no lo sé, pero es el mismo ancho para todas)
Si aún tienes dudas dime las medidas que tienes para meter la gráfica, la mido y vemos si te encaja cómodamente. Si tienes fotos del interior mejor que mejor
Saludos