No he entendido muy bien la ultima frase. Lo que tienes que hacer es simple:
a) creas la correspondiente animación en el swift 3D (ej. 4)
b) la exportas a SWF
c) Abres Macromedia Flash MX y la importas dentro de un simbolo
d) una vez estas dentro de flash puedes maquetar la animación a tu gusto, añadirle musica, en fin, puedes hacer de todo.
Existen diversos plugins de Swift3D, el de lightWave y el de 3DStudio MAX (son los unicos que yo he usado, posiblemente hayan más nuevos ahora) y su función es simple; en vez de usar como gestor 3D el swift 3D usas uno mucho más avanzado en cuantos a caracteristicas (sea 3Dstudio o lightwave). Creas la correspondiente animacioŽn que desees y (una vez instalado el plugin) el mismo 3DStudio o Lightwave te dejará exportarlo directamente a SWF desde el mismo programa sin necesidad de pasar por intermediarios. Te hace el renderizado el mismo con un motor que incorpora el plugin (hecho por electric-rain ( www.erain.com)). Creo que se llama RaviX, ahora mismo no recuerdo exactamente en que versión estan....
Bueno el output (la animación en si) la tendras igual en SWF. Te aconsejo usar Swift·3D directamente para evitar complicaciones con renderizados muy pesados con grandes numeros de poligonos ya que para comenzar no sirve de mucho.
Suerte y sigue descubriendo