Hola:
Quería presentar un hipotético caso. Imaginemos que tenemos una página X con un dominio .es y .com. Ahora queremos crear una página totalmente distinta pero sin pagar nuevamente otro hosting; entonces cojemos otro dominio con otro nombre que no tiene nada que ver. En la página principal habría un script que validaría la dirección entrada y direccionaría a una carpeta distinta para ese nuevo dominio.
Se que esto último es posible porque hace unos años me tocó hacer algo similar.
En este caso, sería tener dos tiendas virtuales, ambas con su base de datos.
Me gustaría saber un poco los inconvenientes de este sistema, por ahí comentan que google te puede penalizar por no tener un hosting por página pero no estoy seguro de que eso pueda ser cierto.
Un saludo y gracias