#3 JEE lo que te da es un framework para poder usar bases de datos y webservers y demás. Vaya, cuando quieras hacer algo mínimamente complejo vas a necesitar recurrir a las librerías que tienes en JEE.
Que al final es un pelín más complejo que eso porque JEE sólo es una especificación y tienes varias implementaciones (como ocurre con JDK, que tienes OpenJDK, Oracle JDK, IBM JDK, etc), pero con que te quedes con la idea de que es una librería grande que está estandarizada vas sobrao. Con esa librería tienes acceso a herramientas para crear servicios de distinto tipo y digerir y manipular datos de varias formas distintas, además de otras cosas.
p.d: los que estáis con el rintintín como si no os hubiese costado entender nunca nada al principio. Debéis de ser unos prodigios.