Un error muy común es pensar que por tener 2 trabajos Hacienda te cobra más... No, Hacienda te cobra en función de lo que ganas anualmente.
Si sólo tienes un trabajo temporal (por ejemplo 6 meses), normalmente te retienen el 2% (el mínimo) ya que tu empresa "piensa" que vas a cobrar sólo 10.000€ (por decir algo) esos 6 meses y desconoce si cobrarás más en un futuro, así que te retiene el 2%
Si después curras en otra empresa 6 meses también, cobrando también 10.000€ y con una retención del 2% (esa segunda empresa hace el mismo cálculo y te retiene el mínimo) habrás ganado en total 20.000€ en un año, aunque sólo te han retenido en los dos trabajos un 2% de IRPF.
Pero por 20.000€ te tocaría pagar un 12-13%, y en la declaración de la renta es donde se calcula lo que has ganado anualmente y lo que has pagado, y te toca pagar lo que no pagaste antes.
Es decir, no se "penaliza" tener 2 o más trabajos, ya sea a la vez o en periodos distintos, el problema es la gente que piensa que tiene un trabajo bien pagado porque le retienen un 2% luego se queja de Hacienda porque le cobran una pasta en la declaración de la renta...
Como comentan antes, si la suma de 2 pagadores es superior a 11.000€ brutos estás obligado a hacer la declaración de la renta, así que muy probablemente te saldrá a pagar.
Con un sólo pagador, no estas obligado a pagar si cobras menos de 22.000€ aprox, por lo que si trabajas 10 meses y te pagan 20.000€ con el 2% de IRPF y no trabajas más en todo el año, puedes ahorrarte una buena pasta de IRPF al no tener que presentar la declaración.