Ya antes del plan Bolonia se permitía en prácticamente cualquier universidad matricularse a tiempo parcial. Si aún no te has decidido por ninguna en concreto, puedes mirar a ver qué condiciones plantean en cada una de las que tengas a mano.
La otra opción es que intentes cuadrar el horario "normal" con el de tu trabajo. Pero, salvo que lo veas muy claro, posiblemente acabes jodiendo varios puntos, que en general no se pueden recuperar. ¿Sabes a qué horas vas a tener que currar? Es relativamente fácil hacerte un horario a medida: para las sesiones teóricas, buscas la hora que mejor se adapte (fíjate en si hacen pruebas de evaluación continua en esas horas para ir el día que cuadre), y para las prácticas, no suelen poner muchos problemas para cambiarte de un grupo a otro (no de manera oficial, sino hablando con el coordinador de la asignatura o los profesores implicados).