Para mi el apt es como 1 religion el man apt es mi coran. Y cada noche antes de dormir le rezo 2 padres apt-get y 5 apt-cache.
Pros y Contras de APT.
pros todos
contras personalmente algo complejo y coñazo en determinadas tareas personalmente prefiero portage
Que diferencia hay entre el sistema de Debian (apt), el de Mandrake (Urpmi) y el de gentoo (emerge) ?¿
aun no he leido ningun pro ni ningun contra.
Pro -> comodidad ya que son paquetes compilados
Contras -> al ser compilado optimizacion -3 ( cosa que si da los portages .... pero tardan en compilar 1000 ; ) )
la compilacion de portage es un efecto colateral de la idea principal que da este la posibilidad de elegir exactamente que hara el programa y que se construira con el por ejemplo al emerger unas x con las use flags podemos decidir compilarlas con distintias opciones entre ellas con soporte para sse que le da bastante rendimiento, asi como por ejemplo en gimp construirlo con instrucciones mmx y se eso se nota tela al renderizar o por ejemplo kde, seleccionar si queremos soporte para sane y un largo etc..., esto no te lo dan los paquetes binarios 
