Lo 1º, si formateas...adios a los datos -existen programas que recuperan parte de los archivos perdidos, pero nunca el 100%-
Creo que se arreglaría -pero perderías todos los datos de forma irrecuperable- con estos pasos:
Paso 1º Hazte con un disquete de arranque de win98 -o en su defecto el cd de instalación de winXP.
Paso 2º Arranca desde el cd/disquete (configura la bios para este paso)
Paso 3º Si usas disquete escribe fdisc, te saldrá un pequeño menu, borras la unidad logica, reinicia, vuelve a ejecutar fdisc y crea una nueva unidad logica (con el 100% del espacio disponible si no vas a usar particiones). Sal de fdisc y formatea el discoduro con poniendo format c:; ya solo te quedará instalar windows.
En cambio, si usas el cd de winXP, comenzará la instalacion y te saldrán los posibles sitios donde instalarlo o la opcion de borrar la unidad logica, escoge esta ultima..y luego crea una unidad logica, formateala e instala.